Über uns

Pflanzen beherbergen eine artenreiche Mikrobiota mit einer Vielzahl von Bakterien, Pilzen oder Oomyzeten und stehen in ständiger Interaktion mit diesen. Diese Mikroorganismen fungieren kollektiv als Mikrobiom und beeinflussen, ähnlich wie die mikrobiellen Gemeinschaften im menschlichen oder tierischen Darm, die Ernährung und Gesundheit ihres Wirtes. So können beispielsweise Mitglieder der Pflanzenmikrobiota die Nährstoffaufnahme verbessern oder den Schutz vor Krankheitserregern gewährleisten. In unserer Forschung befassen wir uns mit den folgenden grundlegenden Fragen der Biologie von Pflanzenmikrobiomen:

- Wie kommunizieren Pflanzen mit der Wurzelmikrobiota und nehmen Einfluss auf deren Aktivitäten?

- Was ist der funktionelle Beitrag der Wurzelmikrobiota zum Pflanzenwachstum und zum Krankheitsschutz?

Ziel unserer Forschung ist letztlich, dass nützliche Interaktionen zwischen Pflanzen und Mikroorganismen in einer intelligenten und nachhaltigen Landwirtschaft eingesetzt werden können. Wir arbeiten hauptsächlich mit Arabidopsis thaliana und Zea mays als Modellpflanzen und kombinieren Feld- und Laborexperimente mit Methoden der Mikrobiomik, Molekularbiologie, Mikrobiologie, Pflanzengenetik und Bioinformatik.

 

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Adresse

Universität Basel
Departement Umweltwissenschaften
Pflanzen Mikroben Interaktionen
Bernoullistrasse 32
CH-4056 Basel

News

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Poster prize for Romina Kalbermatten at the SSP meeting

16.09.2026
Congratulations to Romina Kalbermatten, who received a prize for her poster “Future climatic conditions intensify soilborne diseases in table beet seedlings”, presented at the autumn meeting of the Swiss Society of Phytiatry on 10 September in the beautiful Merian Gardens in Basel.
The poster presents findings from Romina’s Master’s thesis, in which she investigated how future climatic conditions affect seedling damping-off in table beet. Combining pot experiments, microbiome analyses, and infection experiments, she found that disease severity increases under future climatic conditions and is associated with changes in abundance of specific fungal taxa.

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Group Outing: Hike to Discover the Basel-Land Hills and Gorges

01.09.2026
To kick off the new semester on the right foot, a group outing was in order! We decided to explore the hills of Basel-Land, making our way to the famous Stiron sculpture by Franz Stirnimann, and then walking through the “Tüfelsschlucht”, one of the most beautiful gorges in the Jura Mountains. We started the day with a good Gipfeli on the train before arriving in the small village of Langenbruck. From there, we set off through forests and farmland. With good energy, plenty of chats, we eventually reached the sculpture, where we enjoyed a beautiful view over the Olten region. After a well-deserved picnic lunch, we continued our descent towards Hägendorf crossing through the Tüfelsschlucht. The path was beautiful, slightly dry after this warm summer, but still made for a great part of the hike. We ended the day with some very good ice cream cups — the perfect reward after a day of walking!

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